NormSys

Das molekulare Inventar einzelner Zellen und das komplexe Zusammenspiel dieser Moleküle kann man heutzutage mit Hilfe zahlreicher spezifischer Technologien in einer Komplexität und Tiefe analysieren, wie es zuvor nicht möglich war. Diese Daten bilden die Grundlage für Computermodelle in der Systembiologie, mit deren Hilfe die biologischen Prozesse in Organsimen von einer einzelnen Zelle und deren Bestandteilen bis hin zu Geweben, Organen und ganzen Organismen immer besser verstanden werden können. Die systembiologische Forschung zeichnet dabei ein Gesamtbild von den dynamischen Vorgängen des Lebens unter Einbeziehung sämtlicher Ebenen und biologischer Skalen: Vom Genom über das Proteom, das Metabolom und die komplette Zelle und deren Funktionen innerhalb von Geweben und Organen des Körpers, bis hin zum vollständigen Organismus. Die Forschungsdaten werden mit unterschiedlichen Methoden aus den verschiedensten Quellen gewonnen und müssen zur Erstellung der Computermodelle zusammengeführt und integriert werden. Dazu müssen diese Daten in kompatiblen, standardisierten Formaten vorliegen und mit ausreichend Metadaten (Daten, welche die Daten beschreiben und in einen Kontext bringen) versehen sein.

Die Entwicklung und Verbreitung von Standardformaten und Standardterminologien sind eine unverzichtbare Grundlage für jedes Systembiologieprojekt. Diese Standards wurden jedoch in der Vergangenheit relativ unabhängig voneinander von unterschiedlichen fachspezifischen wissenschaftlichen Gemeinschaften eingeführt und weiterentwickelt. Alle diese Initiativen zur Entwicklung von Standards sind größtenteils aus den Problemstellungen der konkreten Forschungsansätze entstanden und können als „Bottom-Up“-Initiativen angesehen werden. Aus diesem Grund gibt es eine große Anzahl unterschiedlicher Initiativen und verschiedener Community-Standards, die häufig nicht kompatibel sind. Durch den schnell wachsenden Komplexitätsgrad systembiologischer Forschung werden der Austausch und die Zusammenarbeit zwischen diesen Gemeinschaften immer wichtiger. Standardisierungsinitiativen müssen also zwingend über die Grenzen fachspezifischer Bereiche hinaus aufeinander abgestimmt werden, um nutzbare Ergebnisse zu generieren.

Ziel von NormSys ist, die weitere Normung und Abstimmung bestehender Community-Standards im Bereich systembiologischer Computermodellierung vorzubereiten, ein Normungskonzept für Modelle und deren Daten zu erarbeiten und den Kontakt zwischen Fachkreisen und offiziellen Normungsinstitutionen auf nationaler (DIN), europäischer (CEN/CENELEC) und internationaler Ebene (ISO) zu vermitteln. Dies wird in enger Zusammenarbeit mit einschlägigen Fachkreisen und bestehenden Standardisierungsinitiativen, wie dem COMBINE-Netzwerk („COmputational Modeling in BIology NEtwork“) umgesetzt.