Focal Adhesion Kinase is a mechanosensor!
MD simulations of a FAK fragment containing the catalytic and FERM domains in different protein system are carried out to compare the dynamics of FAK in the absence or presence of ATP and PIP2. We observe a closing and opening motion upon ATP and additional PIP2 binding respectively, which is in good agreement with the FRET experiments [1]. By using Force Distribution Analysis (FDA), we identified a network spanning from the PIP2 and ATP binding sites to the distant interface between the catalytic and FERM domains.
[1] Gőni, MG. et al. (2014). PNAS. 111, 3177-3186.
Über das HITS
Das HITS (Heidelberger Institut für Theoretische Studien) wurde 2010 von dem Physiker und SAP-Mitbegründer Klaus Tschira (1940-2015) und der Klaus Tschira Stiftung als privates, gemeinnütziges Forschungsinstitut gegründet. Es betreibt Grundlagenforschung in den Naturwissenschaften, der Mathematik und der Informatik. Zu den Hauptforschungsrichtungen zählen komplexe Simulationen auf verschiedenen Skalen, Datenwissenschaft und -analyse sowie die Entwicklung rechnergestützter Tools für die Forschung. Die Anwendungsfelder reichen von der Molekularbiologie bis zur Astrophysik. Ein wesentliches Merkmal des Instituts ist die Interdisziplinarität, die in zahlreichen gruppen- und disziplinübergreifenden Projekten umgesetzt wird. Die Grundfinanzierung des HITS wird von der Klaus Tschira Stiftung bereitgestellt.