Interaction between intrinsically disordered proteins and structured partners
On the line of maturing new understanding of the factors regulating the correct dynamics of intrinsically disordered proteins in solution, one of the group’s interest is studying the mechanisms at the base of IDP’s recognition by structured partners. The function of IDPs is mostly, if not exclusively, developed around their ability to bind other molecular components inside the cell. Nevertheless, their lack of structure poses an additional challenge to successful binding. By employing molecular dynamics and brownian dynamics simulations interfaced to experimental validations, we aim to identify the mechanisms of recognition and binding between IDPs and structured partners crucial to cell surviving. The ultimate goal of the project is to bridge the knowledge that we acquire at a single-molecule level to the function of interacting partners inside the cell.
Über das HITS
Das HITS (Heidelberger Institut für Theoretische Studien) wurde 2010 von dem Physiker und SAP-Mitbegründer Klaus Tschira (1940-2015) und der Klaus Tschira Stiftung als privates, gemeinnütziges Forschungsinstitut gegründet. Es betreibt Grundlagenforschung in den Naturwissenschaften, der Mathematik und der Informatik. Zu den Hauptforschungsrichtungen zählen komplexe Simulationen auf verschiedenen Skalen, Datenwissenschaft und -analyse sowie die Entwicklung rechnergestützter Tools für die Forschung. Die Anwendungsfelder reichen von der Molekularbiologie bis zur Astrophysik. Ein wesentliches Merkmal des Instituts ist die Interdisziplinarität, die in zahlreichen gruppen- und disziplinübergreifenden Projekten umgesetzt wird. Die Grundfinanzierung des HITS wird von der Klaus Tschira Stiftung bereitgestellt.